בית חינוך "יחדיו" הוקם כבית ספר אזורי של הקיבוצים. במהלך השנים עזבו את "יחדיו" תלמידי הקיבוצים שאינם שייכים לדרום השרון וכן תלמידי גליל ים.

ל"יחדיו" הנהלה ציבורית בה חברים נציגי כל הקהילות והיא אחראית על ניהול הכספים והמעקב אחר העשיה החינוכית בבית החינוך. כן מתכנסת הנהלה פדגוגית בה חברות המנהלת ומורות הנבחרות על ידי הצוות. ההנהלה הפדגוגית אחראית על כל המערך הפדגוגי השוטף.

בית החינוך פיתח מערכת משתפת בין התלמידים, המורים, ההנהלה וההורים - ומקיים קשר הדוק עם הקהילות השותפות בבית החינוך. צוות בית החינוך מקפיד להשתלם בדרישות החדשות של משרד החינוך בכל נושאי הלימוד.

בנוסף, מפתח בית החינוך תהליכי למידה ופעילויות בונות שפה, המאפשרות שיתוף וקיום אורח חיים הוגן הנשען על ערכים יהודיים ואוניברסליים.

את בית החינוך "יחדיו" מייחדת עשייה חינוכית רבה:

• לימודי דמוקרטיה: בכל הכיתות מתקיימים לימודי דמוקרטיה הכוללים הכרת השפה הדמוקרטית, המאפשרת דיאלוג משתף לבניית חיים הוגנים בחברת הילדים. מכיתה א' עוסקים במושגים:היכרות עם האני, היכרות עם השונה, קשייו של השונה בקבוצה, דרכים לקבלת החלטות בקבוצה, רוב ומיעוט, זכויות וחובות ואיך כל זה משתלב בחיי הכיתה וחברת התלמידים בבית החינוך.

• פעילות חברתית: הפעילות החברתית בבית החינוך מיישמת את הנלמד בשיעורי הדמקורטיה ומפגישה את כל ילדי בית החינוך במפגש רב גילי.

• חונכות: בבית החינוך חונכים התלמידים הבוגרים את הצעירים בנושאי תוכן שונים כמו קריאה, מדע ומחשבים. תלמידים המבקשים להיות חונכים עוברים הכנה לחונכות ולאחריה נפגשים עם החניך בשעות קבועות במערכת. בסיום התקופה מתקיים מפגש חניכים, חונכים והורים.

• הערכה עצמית: תלמידי בית הספר שותפים אמיתיים בהערכת עצמם ובהערכת פעילויות בית הספר. בתחילת השנה דנים תלמידים ומחנכים בשאלה מה יעריכו במהלך השנה ודף הערכה כיתתי מעוצב בהתאם. פעמים בשנה, בנובמבר ובאפריל, מעריכים התלמידים את עצמם כשהמחנכות מגיבות על הערכתם בכתב ובשיחה אישית.